發燒頭疼時，主要因病毒感染後使頭部肌肉痙攣所致。臨牀上常給予抗病毒類藥物進行症狀的治療，可以較快的緩解頭痛的症狀。
感冒發熱時，會刺激中樞神經導致失調，身體內部會產生許多有害代謝產物如乳酸、二氧化碳、鉀離子等，刺激神經系統，引起神經痛覺反應；另外發熱時交感神經處於興奮狀態，還能產生大量兒茶酚胺，此種物質作用於神經，會導致身體內部循環失常。上面所述的這些物質都有致痛和擴張血管的作用，血管擴張而牽動血管的痛覺末梢神經，從而引發頭痛。
所以發燒頭疼時，患者應盡快按經驗性給予抗病毒藥物治療，如服用臨牀上常用可威磷酸奧司他韋顆粒。
該藥具有較好的神經氨酸酶抑制性，降低病毒的活性，減少病毒的播散，在發病後48小時內開始用藥，效果最佳，能夠更好的減少並發症、縮短病程、降低住院率、以及降低病死率。同時在48小時後使用也有顯著治療效果。
此外，頭痛大多時候頭部會充血，除了藥物治療，也可以在臨睡做足浴，引導血液從頭部回流到足部，給頭部降溫。晚上用溫度稍高一點的熱水泡腳15分鍾，水量淹沒腳腕，泡到雙腳發紅，這樣能起到緩解頭痛的效果。泡腳後要立刻擦幹保溫，防止病情加重。
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