1.預防流產：黃體功能不全可導致孕激素水平降低，可能會造成流產，如果及時發現，補充黃體酮可以預防流產，但是一方面，妊娠期的孕激素水平波動很大，另一方面，有一半患者即使診斷爲黃體功能不全，孕激素水平卻是正常的，同時胚胎發育不良也可能導致孕激素水平低，因此，目前國內外權威指南都不推薦常規檢測孕激素水平指導保胎，服用黃體酮預防流產是無效的，對於反復流產的患者，經驗性地補充黃體酮可能會獲益。
2.經前期緊張綜合症：月經前期體內激素出現劇烈波動，雌激素和孕激素大量分泌，黃體很快萎縮，缺乏雌激素和孕激素，女性就會變得焦躁不安，出現憤怒、抑鬱、焦慮、頭痛、甚至乳房腫痛等情況，被稱爲經前期緊張綜合症，補充黃體酮可有效緩解上述症狀。
3.更年期綜合症：更年期由於卵巢衰退，孕激素和雌激素等性激素水平降低，可出現月經紊亂、潮熱、心慌、失眠、頭痛、耳鳴、抑鬱、焦慮、易怒等症狀，被稱爲更年期綜合症，補充黃體酮可有效緩解上述症狀。
4.月經失調：服用黃體酮後，女性自身孕激素分泌減少，黃體酮代替了女性自身分泌的孕激素，這樣不僅可以抑制排卵，而且可以人工調節月經周期，從而有效減少和避免了閉經、功能性子宮出血、月經不規律、痛經等月經失調現象。
5.子宮內膜癌：黃體酮可抑制垂體後葉促性腺激素的產生，從而導致雌激素分泌減少，可用於治療子宮內膜癌，但目前只適用於腫瘤局限於子宮體的I期患者以及預後較好的患者。
黃體酮與女性體內的孕酮非常相似，但它也是一種人工合成的化學藥物，我們在使用它治療疾病的時候，也自然要承擔它所帶來的副作用，黃體酮常見副作用主要有：
1.胃腸道：常見惡心、腹脹、腹痛、便祕等胃腸道反應，其中惡心是比較常見的胃腸道反應，所以一般建議黃體酮睡前服用，吃完就睡覺，可以使胃腸道反應不那麼明顯。
2.肝髒：服用黃體酮期間可見膽汁淤積、膽汁淤積性肝炎、膽汁淤積性黃疸綜合徵，甚至肝炎、肝壞死、肝功能衰竭等嚴重不良反應，因此，有急性肝病或有肝病史且肝功能未恢復正常的患者應慎用黃體酮，一旦出現嚴重肝損害，應停馬上停藥。
3.神經精神系統：常見頭暈、頭痛、睡眠障礙、嗜睡、抑鬱、心境不定等症狀，尤其有抑鬱症的患者服用黃體酮可能會出現復發或症狀加重，因此，抑鬱症患者應慎用黃體酮。
4.血液系統：長期服用黃體酮可見深靜脈血栓形成、肺栓塞、靜脈血栓栓塞等嚴重不良反應，長期制動的患者發生率增加，服藥期間一旦出現單腿脹痛、突然胸部疼痛、呼吸急促等症狀，應立即就醫。
5.腫瘤：長期服黃體酮可增加乳腺癌、卵巢癌和子宮內膜癌風險，因此，有乳腺癌、卵巢癌和子宮內膜癌家族史的患者應慎用黃體酮。
6.對胎兒的傷害：過度使用黃體酮保胎可導致男性胎兒腎盂擴張、腎積水，甚至生殖器畸形，女性胎兒青春期後出現生殖器官腫瘤等嚴重不良反應。
7.其他：血壓升高、血脂升高、血糖升高、疲勞、水腫等。